MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493575
2	NC_008526	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	116493575
3	NC_008526	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493575
4	NC_008526	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493575
5	NC_008526	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493575
6	NC_008526	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493575
7	NC_008526	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	116493575
8	NC_008526	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493575
9	NC_008526	TAA	2	6	590	595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493575
10	NC_008526	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493575
11	NC_008526	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	116493575
12	NC_008526	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493575
13	NC_008526	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493575
14	NC_008526	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	116493575
15	NC_008526	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	116493575
16	NC_008526	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493575
17	NC_008526	T	6	6	765	770	0 %	100 %	0 %	0 %	116493575
18	NC_008526	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	116493575
19	NC_008526	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	116493575
20	NC_008526	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493575
21	NC_008526	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	116493575
22	NC_008526	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	116493575
23	NC_008526	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493575
24	NC_008526	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	116493575
25	NC_008526	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	116493575
26	NC_008526	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493575
27	NC_008526	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	116493575
28	NC_008526	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493575
29	NC_008526	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493576
30	NC_008526	AAC	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493576
31	NC_008526	CAACG	2	10	1773	1782	40 %	0 %	20 %	40 %	116493576
32	NC_008526	AAT	2	6	1789	1794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493576
33	NC_008526	TCA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493576
34	NC_008526	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493576
35	NC_008526	A	6	6	2258	2263	100 %	0 %	0 %	0 %	116493576
36	NC_008526	CAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493576
37	NC_008526	GAA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493576
38	NC_008526	CAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493576
39	NC_008526	GCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493576
40	NC_008526	AGA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493576
41	NC_008526	TCA	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493576
42	NC_008526	CTAA	2	8	2739	2746	50 %	25 %	0 %	25 %	116493576
43	NC_008526	ACA	2	6	3323	3328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493577
44	NC_008526	T	6	6	3346	3351	0 %	100 %	0 %	0 %	116493577
45	NC_008526	GAG	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493577
46	NC_008526	GAT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493577
47	NC_008526	GGCC	2	8	3499	3506	0 %	0 %	50 %	50 %	116493577
48	NC_008526	TGC	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493578
49	NC_008526	ACA	2	6	3583	3588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
50	NC_008526	AATC	2	8	3650	3657	50 %	25 %	0 %	25 %	116493578
51	NC_008526	CAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
52	NC_008526	TCA	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493578
53	NC_008526	AAC	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
54	NC_008526	GCG	2	6	3918	3923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493578
55	NC_008526	AGC	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493578
56	NC_008526	AGC	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493578
57	NC_008526	ATC	2	6	4034	4039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493578
58	NC_008526	TGAC	2	8	4070	4077	25 %	25 %	25 %	25 %	116493578
59	NC_008526	GC	4	8	4111	4118	0 %	0 %	50 %	50 %	116493578
60	NC_008526	GTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493578
61	NC_008526	TGC	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493578
62	NC_008526	AGC	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493578
63	NC_008526	GC	3	6	4285	4290	0 %	0 %	50 %	50 %	116493578
64	NC_008526	GAT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493578
65	NC_008526	GTT	2	6	4338	4343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493578
66	NC_008526	CAA	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
67	NC_008526	CAC	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493578
68	NC_008526	TGT	2	6	4481	4486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493578
69	NC_008526	ACC	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493578
70	NC_008526	ATC	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493578
71	NC_008526	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493578
72	NC_008526	AAGA	2	8	4906	4913	75 %	0 %	25 %	0 %	116493579
73	NC_008526	GAAGA	2	10	4921	4930	60 %	0 %	40 %	0 %	116493579
74	NC_008526	GGC	2	6	4941	4946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
75	NC_008526	ATG	2	6	4952	4957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
76	NC_008526	CCAG	2	8	4958	4965	25 %	0 %	25 %	50 %	116493579
77	NC_008526	AGC	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493579
78	NC_008526	CAT	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493579
79	NC_008526	TGA	2	6	5079	5084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
80	NC_008526	GCTG	2	8	5088	5095	0 %	25 %	50 %	25 %	116493579
81	NC_008526	TTGAAG	2	12	5111	5122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
82	NC_008526	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493579
83	NC_008526	GGT	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
84	NC_008526	CGG	4	12	5247	5258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
85	NC_008526	GTG	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
86	NC_008526	TAC	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493579
87	NC_008526	GGCAC	2	10	5407	5416	20 %	0 %	40 %	40 %	116493579
88	NC_008526	GAT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
89	NC_008526	ACC	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493579
90	NC_008526	GC	3	6	5565	5570	0 %	0 %	50 %	50 %	116493579
91	NC_008526	GGC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
92	NC_008526	A	6	6	5641	5646	100 %	0 %	0 %	0 %	116493579
93	NC_008526	GACAA	2	10	5681	5690	60 %	0 %	20 %	20 %	116493579
94	NC_008526	TTG	2	6	5743	5748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493579
95	NC_008526	CAA	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493579
96	NC_008526	GGC	2	6	5779	5784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
97	NC_008526	GAT	2	6	5866	5871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
98	NC_008526	GAT	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
99	NC_008526	CGG	2	6	5906	5911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
100	NC_008526	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
101	NC_008526	GGC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
102	NC_008526	CCTG	2	8	6153	6160	0 %	25 %	25 %	50 %	116493579
103	NC_008526	ACA	2	6	6173	6178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493579
104	NC_008526	ATT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493579
105	NC_008526	TCG	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493579
106	NC_008526	TGG	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
107	NC_008526	GAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493579
108	NC_008526	CCGATG	2	12	6434	6445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116493579
109	NC_008526	TTG	2	6	6469	6474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493579
110	NC_008526	GCC	2	6	6537	6542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493579
111	NC_008526	AT	3	6	6576	6581	50 %	50 %	0 %	0 %	116493579
112	NC_008526	GAA	2	6	6592	6597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493579
113	NC_008526	GCC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493579
114	NC_008526	GAC	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493579
115	NC_008526	TGTT	2	8	6827	6834	0 %	75 %	25 %	0 %	116493579
116	NC_008526	AAC	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493579
117	NC_008526	TTGA	2	8	6855	6862	25 %	50 %	25 %	0 %	116493579
118	NC_008526	GAT	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
119	NC_008526	CGG	2	6	7058	7063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493580
120	NC_008526	ATGA	2	8	7076	7083	50 %	25 %	25 %	0 %	116493580
121	NC_008526	AAG	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493580
122	NC_008526	TTG	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493580
123	NC_008526	TGC	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493580
124	NC_008526	CAA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493580
125	NC_008526	GATT	2	8	7348	7355	25 %	50 %	25 %	0 %	116493580
126	NC_008526	ATG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
127	NC_008526	GTT	2	6	7391	7396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493580
128	NC_008526	CGGT	2	8	7446	7453	0 %	25 %	50 %	25 %	116493580
129	NC_008526	GAC	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
130	NC_008526	CCG	2	6	7469	7474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493580
131	NC_008526	CGG	2	6	7579	7584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493580
132	NC_008526	AT	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	116493580
133	NC_008526	GAAAA	2	10	7766	7775	80 %	0 %	20 %	0 %	116493580
134	NC_008526	TGG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493580
135	NC_008526	ATC	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
136	NC_008526	TCG	2	6	8005	8010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493580
137	NC_008526	TGA	2	6	8089	8094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
138	NC_008526	ATC	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
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143	NC_008526	TGAAGA	2	12	8404	8415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116493580
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157	NC_008526	GACAA	2	10	8892	8901	60 %	0 %	20 %	20 %	116493580
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160	NC_008526	GAC	2	6	9305	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
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164	NC_008526	GCA	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
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169	NC_008526	TTTC	2	8	9813	9820	0 %	75 %	0 %	25 %	116493581
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251	NC_008526	GAT	2	6	14370	14375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493586
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255	NC_008526	TTCT	2	8	14532	14539	0 %	75 %	0 %	25 %	116493586
256	NC_008526	CAAT	2	8	14570	14577	50 %	25 %	0 %	25 %	116493586
257	NC_008526	CCA	2	6	14637	14642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493586
258	NC_008526	GCG	2	6	14677	14682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493586
259	NC_008526	CGG	2	6	14747	14752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493586
260	NC_008526	TCA	2	6	14797	14802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493586
261	NC_008526	A	6	6	14802	14807	100 %	0 %	0 %	0 %	116493586
262	NC_008526	CAA	2	6	14824	14829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493586
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266	NC_008526	TTG	2	6	15091	15096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493586
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387	NC_008526	CAT	2	6	24215	24220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493596
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